跨学科合作新突破:生命科学与计算机科学联合研发 线粒体基因组结构多样性量化工具

发布者:李素珍发布时间:2024-11-22浏览次数:14

近日,江西师范大学半岛公司官方网站(广州)股份有限公司牛耕耘副教授与计算机信息工程学院石海鹤教授团队合作,成功研发出一种名为qGO的新型统计方法。该方法专注于量化动物线粒体基因组中的组织多样性。相关研究成果以研究论文形式发表在BMC Genomics(中科院二区Top)上,江西师范大学作为该论文的唯一完成单位,牛耕耘副教授为通讯作者。同时,该研究成果还获得了2项国家发明专利授权。

线粒体基因组,作为真核细胞内承担呼吸、氧化磷酸化等关键功能的遗传物质,其结构与遗传多样性对于解析生物演化具有重要意义。然而,精确量化线粒体基因组的结构变异特征,尤其是基于同源性的统计方法来衡量重组现象,一直是研究中的难点。qGO方法基于基因顺序的同源性分析,通过划分基因簇,并为不同区域的基因分配特定权重,基于统计算法,生成详尽的成对距离矩阵,从而实现对线粒体基因组结构组织多样性的全面量化。这一创新为线粒体基因组多样性的研究提供了新工具,有望拓展线粒体基因组比较研究的范围,使其能够涵盖整个后生动物群体。同时,对于深入理解基因组进化规律、探索基因组功能以及研究分子进化过程具有重要意义。

原文链接:https://link.springer.com/article/10.1186/s12864-024-11006-6